Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ95

NSD3, Histone-lysine N-methyltransferase NSD3, humanhuman

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD3Q9BZ95 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NSD3Q9BZ95 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms