Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RTKNQ9BST9 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RTKNQ9BST9 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms