Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF0

C2orf88, Small membrane A-kinase anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf88Q9BSF0 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
C2orf88Q9BSF0 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms