Protein–RNA interactions for Protein: Q99999

GAL3ST1, Galactosylceramide sulfotransferase, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAL3ST1Q99999 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GAL3ST1Q99999 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms