Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms