Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC85AQ96PX6 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC85AQ96PX6 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms