Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms