Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM63Q969Q1 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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