Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
SNX29Q8TEQ0 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNX29Q8TEQ0 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms