Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.3 ms