Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP4

C17orf47, Uncharacterized protein C17orf47, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf47Q8NEP4 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms