Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDY6

BHLHE23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE23Q8NDY6 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHE23Q8NDY6 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms