Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CHCHD4Q8N4Q1 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
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