Protein–RNA interactions for Protein: Q8N456

LRRC18, Leucine-rich repeat-containing protein 18, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC18Q8N456 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC18Q8N456 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC18Q8N456 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC18Q8N456 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC18Q8N456 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC18Q8N456 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC18Q8N456 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC18Q8N456 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC18Q8N456 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC18Q8N456 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC18Q8N456 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC18Q8N456 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC18Q8N456 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC18Q8N456 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC18Q8N456 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC18Q8N456 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC18Q8N456 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC18Q8N456 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC18Q8N456 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC18Q8N456 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC18Q8N456 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC18Q8N456 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC18Q8N456 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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LRRC18Q8N456 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC18Q8N456 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC18Q8N456 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC18Q8N456 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC18Q8N456 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC18Q8N456 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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LRRC18Q8N456 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC18Q8N456 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC18Q8N456 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC18Q8N456 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC18Q8N456 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC18Q8N456 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LRRC18Q8N456 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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LRRC18Q8N456 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC18Q8N456 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LRRC18Q8N456 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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LRRC18Q8N456 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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LRRC18Q8N456 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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LRRC18Q8N456 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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LRRC18Q8N456 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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LRRC18Q8N456 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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LRRC18Q8N456 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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LRRC18Q8N456 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LRRC18Q8N456 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LRRC18Q8N456 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC18Q8N456 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC18Q8N456 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC18Q8N456 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC18Q8N456 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC18Q8N456 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC18Q8N456 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC18Q8N456 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC18Q8N456 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC18Q8N456 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC18Q8N456 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC18Q8N456 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC18Q8N456 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC18Q8N456 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC18Q8N456 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC18Q8N456 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC18Q8N456 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC18Q8N456 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC18Q8N456 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC18Q8N456 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC18Q8N456 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC18Q8N456 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC18Q8N456 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRC18Q8N456 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms