Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYM1

SEPT12, Septin-12, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEPT12Q8IYM1 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEPT12Q8IYM1 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEPT12Q8IYM1 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEPT12Q8IYM1 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEPT12Q8IYM1 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEPT12Q8IYM1 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEPT12Q8IYM1 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SEPT12Q8IYM1 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEPT12Q8IYM1 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEPT12Q8IYM1 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEPT12Q8IYM1 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEPT12Q8IYM1 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEPT12Q8IYM1 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEPT12Q8IYM1 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEPT12Q8IYM1 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEPT12Q8IYM1 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SEPT12Q8IYM1 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.31
SEPT12Q8IYM1 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEPT12Q8IYM1 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEPT12Q8IYM1 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEPT12Q8IYM1 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEPT12Q8IYM1 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEPT12Q8IYM1 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEPT12Q8IYM1 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEPT12Q8IYM1 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEPT12Q8IYM1 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SEPT12Q8IYM1 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEPT12Q8IYM1 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEPT12Q8IYM1 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEPT12Q8IYM1 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEPT12Q8IYM1 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEPT12Q8IYM1 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEPT12Q8IYM1 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEPT12Q8IYM1 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEPT12Q8IYM1 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEPT12Q8IYM1 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEPT12Q8IYM1 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEPT12Q8IYM1 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEPT12Q8IYM1 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SEPT12Q8IYM1 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SEPT12Q8IYM1 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEPT12Q8IYM1 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SEPT12Q8IYM1 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEPT12Q8IYM1 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEPT12Q8IYM1 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEPT12Q8IYM1 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEPT12Q8IYM1 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEPT12Q8IYM1 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEPT12Q8IYM1 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEPT12Q8IYM1 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEPT12Q8IYM1 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEPT12Q8IYM1 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEPT12Q8IYM1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEPT12Q8IYM1 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEPT12Q8IYM1 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEPT12Q8IYM1 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEPT12Q8IYM1 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEPT12Q8IYM1 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEPT12Q8IYM1 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEPT12Q8IYM1 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEPT12Q8IYM1 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEPT12Q8IYM1 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEPT12Q8IYM1 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEPT12Q8IYM1 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEPT12Q8IYM1 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEPT12Q8IYM1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEPT12Q8IYM1 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEPT12Q8IYM1 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEPT12Q8IYM1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEPT12Q8IYM1 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEPT12Q8IYM1 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEPT12Q8IYM1 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEPT12Q8IYM1 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEPT12Q8IYM1 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEPT12Q8IYM1 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEPT12Q8IYM1 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEPT12Q8IYM1 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEPT12Q8IYM1 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEPT12Q8IYM1 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEPT12Q8IYM1 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEPT12Q8IYM1 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEPT12Q8IYM1 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEPT12Q8IYM1 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEPT12Q8IYM1 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEPT12Q8IYM1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEPT12Q8IYM1 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEPT12Q8IYM1 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SEPT12Q8IYM1 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEPT12Q8IYM1 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEPT12Q8IYM1 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEPT12Q8IYM1 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEPT12Q8IYM1 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEPT12Q8IYM1 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEPT12Q8IYM1 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEPT12Q8IYM1 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEPT12Q8IYM1 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEPT12Q8IYM1 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEPT12Q8IYM1 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEPT12Q8IYM1 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEPT12Q8IYM1 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms