Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y8

KRT27, Keratin, type I cytoskeletal 27, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT27Q7Z3Y8 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT27Q7Z3Y8 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT27Q7Z3Y8 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT27Q7Z3Y8 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT27Q7Z3Y8 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT27Q7Z3Y8 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT27Q7Z3Y8 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT27Q7Z3Y8 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT27Q7Z3Y8 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT27Q7Z3Y8 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT27Q7Z3Y8 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT27Q7Z3Y8 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT27Q7Z3Y8 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT27Q7Z3Y8 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT27Q7Z3Y8 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT27Q7Z3Y8 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT27Q7Z3Y8 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT27Q7Z3Y8 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT27Q7Z3Y8 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT27Q7Z3Y8 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT27Q7Z3Y8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT27Q7Z3Y8 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT27Q7Z3Y8 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT27Q7Z3Y8 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT27Q7Z3Y8 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT27Q7Z3Y8 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT27Q7Z3Y8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KRT27Q7Z3Y8 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KRT27Q7Z3Y8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KRT27Q7Z3Y8 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
KRT27Q7Z3Y8 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KRT27Q7Z3Y8 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT27Q7Z3Y8 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms