Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RUFY3Q7L099 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RUFY3Q7L099 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RUFY3Q7L099 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
RUFY3Q7L099 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms