Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRZ4

C9orf47, Uncharacterized protein C9orf47, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf47Q6ZRZ4 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf47Q6ZRZ4 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms