Protein–RNA interactions for Protein: Q6U841

SLC4A10, Sodium-driven chloride bicarbonate exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A10Q6U841 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC4A10Q6U841 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms