Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC171Q6TFL3 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms