Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SMARCD3Q6STE5 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms