Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C1

SLC25A47, Solute carrier family 25 member 47, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A47Q6Q0C1 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC25A47Q6Q0C1 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC25A47Q6Q0C1 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC25A47Q6Q0C1 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC25A47Q6Q0C1 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC25A47Q6Q0C1 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC25A47Q6Q0C1 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC25A47Q6Q0C1 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC25A47Q6Q0C1 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC25A47Q6Q0C1 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC25A47Q6Q0C1 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC25A47Q6Q0C1 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC25A47Q6Q0C1 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC25A47Q6Q0C1 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC25A47Q6Q0C1 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC25A47Q6Q0C1 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC25A47Q6Q0C1 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC25A47Q6Q0C1 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC25A47Q6Q0C1 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC25A47Q6Q0C1 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC25A47Q6Q0C1 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC25A47Q6Q0C1 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC25A47Q6Q0C1 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC25A47Q6Q0C1 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC25A47Q6Q0C1 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC25A47Q6Q0C1 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC25A47Q6Q0C1 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC25A47Q6Q0C1 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC25A47Q6Q0C1 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC25A47Q6Q0C1 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC25A47Q6Q0C1 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC25A47Q6Q0C1 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC25A47Q6Q0C1 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC25A47Q6Q0C1 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC25A47Q6Q0C1 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC25A47Q6Q0C1 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC25A47Q6Q0C1 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC25A47Q6Q0C1 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC25A47Q6Q0C1 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC25A47Q6Q0C1 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC25A47Q6Q0C1 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC25A47Q6Q0C1 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC25A47Q6Q0C1 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC25A47Q6Q0C1 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC25A47Q6Q0C1 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC25A47Q6Q0C1 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC25A47Q6Q0C1 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC25A47Q6Q0C1 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC25A47Q6Q0C1 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC25A47Q6Q0C1 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC25A47Q6Q0C1 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC25A47Q6Q0C1 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC25A47Q6Q0C1 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC25A47Q6Q0C1 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC25A47Q6Q0C1 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC25A47Q6Q0C1 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC25A47Q6Q0C1 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC25A47Q6Q0C1 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC25A47Q6Q0C1 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC25A47Q6Q0C1 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC25A47Q6Q0C1 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC25A47Q6Q0C1 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC25A47Q6Q0C1 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC25A47Q6Q0C1 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC25A47Q6Q0C1 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC25A47Q6Q0C1 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC25A47Q6Q0C1 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC25A47Q6Q0C1 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC25A47Q6Q0C1 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC25A47Q6Q0C1 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC25A47Q6Q0C1 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC25A47Q6Q0C1 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC25A47Q6Q0C1 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC25A47Q6Q0C1 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC25A47Q6Q0C1 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC25A47Q6Q0C1 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC25A47Q6Q0C1 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC25A47Q6Q0C1 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC25A47Q6Q0C1 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC25A47Q6Q0C1 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC25A47Q6Q0C1 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC25A47Q6Q0C1 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC25A47Q6Q0C1 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC25A47Q6Q0C1 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC25A47Q6Q0C1 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC25A47Q6Q0C1 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC25A47Q6Q0C1 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC25A47Q6Q0C1 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC25A47Q6Q0C1 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC25A47Q6Q0C1 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC25A47Q6Q0C1 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC25A47Q6Q0C1 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC25A47Q6Q0C1 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC25A47Q6Q0C1 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC25A47Q6Q0C1 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC25A47Q6Q0C1 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC25A47Q6Q0C1 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC25A47Q6Q0C1 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC25A47Q6Q0C1 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC25A47Q6Q0C1 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms