Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ49

SDE2, Protein SDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDE2Q6IQ49 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SDE2Q6IQ49 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms