Protein–RNA interactions for Protein: Q6IC98

GRAMD4, GRAM domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD4Q6IC98 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRAMD4Q6IC98 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRAMD4Q6IC98 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRAMD4Q6IC98 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRAMD4Q6IC98 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRAMD4Q6IC98 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRAMD4Q6IC98 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRAMD4Q6IC98 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRAMD4Q6IC98 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRAMD4Q6IC98 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRAMD4Q6IC98 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRAMD4Q6IC98 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRAMD4Q6IC98 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRAMD4Q6IC98 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRAMD4Q6IC98 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRAMD4Q6IC98 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRAMD4Q6IC98 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRAMD4Q6IC98 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRAMD4Q6IC98 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRAMD4Q6IC98 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRAMD4Q6IC98 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRAMD4Q6IC98 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRAMD4Q6IC98 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRAMD4Q6IC98 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GRAMD4Q6IC98 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRAMD4Q6IC98 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRAMD4Q6IC98 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRAMD4Q6IC98 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRAMD4Q6IC98 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRAMD4Q6IC98 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRAMD4Q6IC98 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRAMD4Q6IC98 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRAMD4Q6IC98 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRAMD4Q6IC98 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRAMD4Q6IC98 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRAMD4Q6IC98 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRAMD4Q6IC98 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRAMD4Q6IC98 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRAMD4Q6IC98 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRAMD4Q6IC98 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRAMD4Q6IC98 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GRAMD4Q6IC98 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GRAMD4Q6IC98 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GRAMD4Q6IC98 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GRAMD4Q6IC98 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
GRAMD4Q6IC98 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GRAMD4Q6IC98 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GRAMD4Q6IC98 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRAMD4Q6IC98 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRAMD4Q6IC98 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRAMD4Q6IC98 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GRAMD4Q6IC98 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRAMD4Q6IC98 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRAMD4Q6IC98 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRAMD4Q6IC98 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRAMD4Q6IC98 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRAMD4Q6IC98 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRAMD4Q6IC98 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRAMD4Q6IC98 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRAMD4Q6IC98 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRAMD4Q6IC98 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRAMD4Q6IC98 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRAMD4Q6IC98 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRAMD4Q6IC98 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRAMD4Q6IC98 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRAMD4Q6IC98 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRAMD4Q6IC98 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRAMD4Q6IC98 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRAMD4Q6IC98 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRAMD4Q6IC98 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRAMD4Q6IC98 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRAMD4Q6IC98 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRAMD4Q6IC98 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRAMD4Q6IC98 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRAMD4Q6IC98 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRAMD4Q6IC98 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GRAMD4Q6IC98 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRAMD4Q6IC98 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRAMD4Q6IC98 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRAMD4Q6IC98 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRAMD4Q6IC98 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GRAMD4Q6IC98 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRAMD4Q6IC98 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GRAMD4Q6IC98 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRAMD4Q6IC98 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRAMD4Q6IC98 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRAMD4Q6IC98 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRAMD4Q6IC98 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRAMD4Q6IC98 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GRAMD4Q6IC98 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRAMD4Q6IC98 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRAMD4Q6IC98 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRAMD4Q6IC98 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRAMD4Q6IC98 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRAMD4Q6IC98 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRAMD4Q6IC98 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRAMD4Q6IC98 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRAMD4Q6IC98 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRAMD4Q6IC98 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRAMD4Q6IC98 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms