Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTM2

AGAP9, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP9Q5VTM2 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AGAP9Q5VTM2 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms