Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSD8

Putative uncharacterized protein LOC401522, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5VSD8 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q5VSD8 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q5VSD8 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q5VSD8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q5VSD8 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q5VSD8 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q5VSD8 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q5VSD8 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q5VSD8 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q5VSD8 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q5VSD8 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q5VSD8 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q5VSD8 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q5VSD8 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Q5VSD8 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Q5VSD8 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q5VSD8 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q5VSD8 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Q5VSD8 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q5VSD8 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q5VSD8 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q5VSD8 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q5VSD8 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Q5VSD8 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q5VSD8 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q5VSD8 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q5VSD8 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q5VSD8 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Q5VSD8 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Q5VSD8 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Q5VSD8 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Q5VSD8 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Q5VSD8 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Q5VSD8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Q5VSD8 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Q5VSD8 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Q5VSD8 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Q5VSD8 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Q5VSD8 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Q5VSD8 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Q5VSD8 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Q5VSD8 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Q5VSD8 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Q5VSD8 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Q5VSD8 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Q5VSD8 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Q5VSD8 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Q5VSD8 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Q5VSD8 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Q5VSD8 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q5VSD8 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q5VSD8 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q5VSD8 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q5VSD8 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q5VSD8 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q5VSD8 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q5VSD8 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q5VSD8 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q5VSD8 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q5VSD8 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q5VSD8 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q5VSD8 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q5VSD8 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q5VSD8 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q5VSD8 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q5VSD8 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q5VSD8 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q5VSD8 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q5VSD8 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q5VSD8 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q5VSD8 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q5VSD8 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q5VSD8 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q5VSD8 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q5VSD8 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Q5VSD8 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Q5VSD8 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q5VSD8 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q5VSD8 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q5VSD8 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q5VSD8 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q5VSD8 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q5VSD8 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q5VSD8 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Q5VSD8 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Q5VSD8 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q5VSD8 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q5VSD8 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q5VSD8 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Q5VSD8 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Q5VSD8 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q5VSD8 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q5VSD8 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q5VSD8 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q5VSD8 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q5VSD8 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q5VSD8 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q5VSD8 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q5VSD8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q5VSD8 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms