Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
LDLRAP1Q5SW96 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms