Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUP188Q5SRE5 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
NUP188Q5SRE5 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
NUP188Q5SRE5 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NUP188Q5SRE5 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NUP188Q5SRE5 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NUP188Q5SRE5 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NUP188Q5SRE5 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NUP188Q5SRE5 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NUP188Q5SRE5 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUP188Q5SRE5 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUP188Q5SRE5 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NUP188Q5SRE5 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUP188Q5SRE5 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUP188Q5SRE5 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUP188Q5SRE5 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUP188Q5SRE5 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NUP188Q5SRE5 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUP188Q5SRE5 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUP188Q5SRE5 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUP188Q5SRE5 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP188Q5SRE5 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP188Q5SRE5 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP188Q5SRE5 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP188Q5SRE5 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP188Q5SRE5 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP188Q5SRE5 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP188Q5SRE5 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP188Q5SRE5 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP188Q5SRE5 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP188Q5SRE5 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP188Q5SRE5 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP188Q5SRE5 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP188Q5SRE5 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP188Q5SRE5 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP188Q5SRE5 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP188Q5SRE5 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP188Q5SRE5 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP188Q5SRE5 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP188Q5SRE5 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP188Q5SRE5 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP188Q5SRE5 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP188Q5SRE5 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP188Q5SRE5 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP188Q5SRE5 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP188Q5SRE5 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP188Q5SRE5 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP188Q5SRE5 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP188Q5SRE5 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms