Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCID2Q5JVF3 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms