Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTW2

CEP78, Centrosomal protein of 78 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP78Q5JTW2 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CEP78Q5JTW2 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms