Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SDK2Q58EX2 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SDK2Q58EX2 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SDK2Q58EX2 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SDK2Q58EX2 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SDK2Q58EX2 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SDK2Q58EX2 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SDK2Q58EX2 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SDK2Q58EX2 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SDK2Q58EX2 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SDK2Q58EX2 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SDK2Q58EX2 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SDK2Q58EX2 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SDK2Q58EX2 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SDK2Q58EX2 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SDK2Q58EX2 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SDK2Q58EX2 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
SDK2Q58EX2 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
SDK2Q58EX2 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SDK2Q58EX2 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SDK2Q58EX2 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
SDK2Q58EX2 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SDK2Q58EX2 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SDK2Q58EX2 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
SDK2Q58EX2 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SDK2Q58EX2 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms