Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MSMPQ1L6U9 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
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