Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL24A1Q17RW2 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL24A1Q17RW2 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL24A1Q17RW2 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL24A1Q17RW2 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL24A1Q17RW2 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL24A1Q17RW2 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
COL24A1Q17RW2 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms