Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IMPG1Q17R60 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms