Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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PTPRNQ16849 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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PTPRNQ16849 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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PTPRNQ16849 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
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