Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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PTPROQ16827 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
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PTPROQ16827 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
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PTPROQ16827 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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PTPROQ16827 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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PTPROQ16827 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
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PTPROQ16827 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
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PTPROQ16827 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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