Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RTN1Q16799 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RTN1Q16799 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RTN1Q16799 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RTN1Q16799 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RTN1Q16799 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RTN1Q16799 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RTN1Q16799 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RTN1Q16799 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RTN1Q16799 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RTN1Q16799 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RTN1Q16799 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RTN1Q16799 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RTN1Q16799 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RTN1Q16799 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RTN1Q16799 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RTN1Q16799 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RTN1Q16799 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RTN1Q16799 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RTN1Q16799 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RTN1Q16799 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RTN1Q16799 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RTN1Q16799 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RTN1Q16799 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RTN1Q16799 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RTN1Q16799 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RTN1Q16799 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RTN1Q16799 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RTN1Q16799 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RTN1Q16799 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RTN1Q16799 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
RTN1Q16799 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RTN1Q16799 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
RTN1Q16799 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RTN1Q16799 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
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RTN1Q16799 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RTN1Q16799 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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RTN1Q16799 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RTN1Q16799 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RTN1Q16799 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RTN1Q16799 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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RTN1Q16799 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RTN1Q16799 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RTN1Q16799 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
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RTN1Q16799 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
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RTN1Q16799 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RTN1Q16799 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RTN1Q16799 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RTN1Q16799 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
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RTN1Q16799 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
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RTN1Q16799 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RTN1Q16799 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
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RTN1Q16799 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
RTN1Q16799 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RTN1Q16799 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RTN1Q16799 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RTN1Q16799 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RTN1Q16799 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RTN1Q16799 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RTN1Q16799 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RTN1Q16799 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RTN1Q16799 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RTN1Q16799 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RTN1Q16799 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RTN1Q16799 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RTN1Q16799 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RTN1Q16799 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RTN1Q16799 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RTN1Q16799 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
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