Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
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ME3Q16798 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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ME3Q16798 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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ME3Q16798 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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ME3Q16798 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ME3Q16798 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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