Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
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LAMA3Q16787 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
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LAMA3Q16787 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
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LAMA3Q16787 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
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LAMA3Q16787 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
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LAMA3Q16787 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
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LAMA3Q16787 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
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LAMA3Q16787 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
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LAMA3Q16787 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
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LAMA3Q16787 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
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