Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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