Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
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