Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
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