Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms