Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
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