Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ALX1Q15699 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
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ALX1Q15699 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
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ALX1Q15699 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ALX1Q15699 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
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