Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC21.33■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NECTIN1Q15223 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
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