Protein–RNA interactions for Protein: Q15021

NCAPD2, Condensin complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPD2Q15021 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NCAPD2Q15021 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NCAPD2Q15021 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NCAPD2Q15021 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NCAPD2Q15021 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NCAPD2Q15021 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NCAPD2Q15021 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NCAPD2Q15021 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NCAPD2Q15021 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NCAPD2Q15021 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NCAPD2Q15021 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NCAPD2Q15021 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NCAPD2Q15021 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NCAPD2Q15021 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NCAPD2Q15021 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NCAPD2Q15021 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NCAPD2Q15021 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NCAPD2Q15021 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NCAPD2Q15021 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NCAPD2Q15021 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCAPD2Q15021 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCAPD2Q15021 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCAPD2Q15021 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCAPD2Q15021 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NCAPD2Q15021 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCAPD2Q15021 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCAPD2Q15021 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCAPD2Q15021 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCAPD2Q15021 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCAPD2Q15021 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCAPD2Q15021 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCAPD2Q15021 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCAPD2Q15021 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NCAPD2Q15021 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCAPD2Q15021 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCAPD2Q15021 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCAPD2Q15021 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCAPD2Q15021 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCAPD2Q15021 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCAPD2Q15021 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCAPD2Q15021 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCAPD2Q15021 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NCAPD2Q15021 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NCAPD2Q15021 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCAPD2Q15021 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCAPD2Q15021 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCAPD2Q15021 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NCAPD2Q15021 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCAPD2Q15021 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCAPD2Q15021 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCAPD2Q15021 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCAPD2Q15021 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCAPD2Q15021 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCAPD2Q15021 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCAPD2Q15021 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCAPD2Q15021 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NCAPD2Q15021 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NCAPD2Q15021 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NCAPD2Q15021 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NCAPD2Q15021 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NCAPD2Q15021 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NCAPD2Q15021 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NCAPD2Q15021 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NCAPD2Q15021 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NCAPD2Q15021 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NCAPD2Q15021 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NCAPD2Q15021 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NCAPD2Q15021 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NCAPD2Q15021 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NCAPD2Q15021 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NCAPD2Q15021 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NCAPD2Q15021 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NCAPD2Q15021 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NCAPD2Q15021 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NCAPD2Q15021 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NCAPD2Q15021 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCAPD2Q15021 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCAPD2Q15021 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCAPD2Q15021 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCAPD2Q15021 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCAPD2Q15021 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCAPD2Q15021 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCAPD2Q15021 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCAPD2Q15021 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NCAPD2Q15021 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCAPD2Q15021 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCAPD2Q15021 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NCAPD2Q15021 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCAPD2Q15021 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCAPD2Q15021 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCAPD2Q15021 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCAPD2Q15021 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NCAPD2Q15021 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCAPD2Q15021 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCAPD2Q15021 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCAPD2Q15021 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCAPD2Q15021 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCAPD2Q15021 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCAPD2Q15021 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCAPD2Q15021 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms