Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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COL19A1Q14993 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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COL19A1Q14993 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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COL19A1Q14993 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COL19A1Q14993 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
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COL19A1Q14993 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COL19A1Q14993 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COL19A1Q14993 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COL19A1Q14993 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
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COL19A1Q14993 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COL19A1Q14993 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COL19A1Q14993 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
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COL19A1Q14993 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COL19A1Q14993 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COL19A1Q14993 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COL19A1Q14993 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
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COL19A1Q14993 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
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COL19A1Q14993 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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COL19A1Q14993 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL19A1Q14993 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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COL19A1Q14993 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COL19A1Q14993 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COL19A1Q14993 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COL19A1Q14993 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COL19A1Q14993 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
COL19A1Q14993 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COL19A1Q14993 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COL19A1Q14993 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COL19A1Q14993 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COL19A1Q14993 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COL19A1Q14993 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COL19A1Q14993 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COL19A1Q14993 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COL19A1Q14993 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COL19A1Q14993 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COL19A1Q14993 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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COL19A1Q14993 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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