Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMCO1Q147U7 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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