Protein–RNA interactions for Protein: Q14574

DSC3, Desmocollin-3, humanhuman

Predictions only

Length 896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC3Q14574 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DSC3Q14574 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DSC3Q14574 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DSC3Q14574 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DSC3Q14574 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DSC3Q14574 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DSC3Q14574 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DSC3Q14574 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DSC3Q14574 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DSC3Q14574 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DSC3Q14574 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DSC3Q14574 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DSC3Q14574 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DSC3Q14574 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DSC3Q14574 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DSC3Q14574 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DSC3Q14574 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DSC3Q14574 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DSC3Q14574 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
DSC3Q14574 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DSC3Q14574 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DSC3Q14574 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DSC3Q14574 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
DSC3Q14574 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
DSC3Q14574 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DSC3Q14574 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DSC3Q14574 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DSC3Q14574 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DSC3Q14574 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DSC3Q14574 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DSC3Q14574 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DSC3Q14574 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DSC3Q14574 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DSC3Q14574 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DSC3Q14574 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DSC3Q14574 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DSC3Q14574 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
DSC3Q14574 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DSC3Q14574 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
DSC3Q14574 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DSC3Q14574 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DSC3Q14574 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DSC3Q14574 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DSC3Q14574 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
DSC3Q14574 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
DSC3Q14574 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DSC3Q14574 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DSC3Q14574 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DSC3Q14574 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DSC3Q14574 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DSC3Q14574 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DSC3Q14574 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DSC3Q14574 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DSC3Q14574 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DSC3Q14574 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DSC3Q14574 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DSC3Q14574 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DSC3Q14574 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DSC3Q14574 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DSC3Q14574 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DSC3Q14574 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DSC3Q14574 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DSC3Q14574 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DSC3Q14574 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DSC3Q14574 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DSC3Q14574 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
DSC3Q14574 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DSC3Q14574 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DSC3Q14574 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DSC3Q14574 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DSC3Q14574 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DSC3Q14574 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DSC3Q14574 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DSC3Q14574 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
DSC3Q14574 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DSC3Q14574 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DSC3Q14574 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DSC3Q14574 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DSC3Q14574 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DSC3Q14574 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DSC3Q14574 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DSC3Q14574 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DSC3Q14574 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DSC3Q14574 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DSC3Q14574 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DSC3Q14574 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
DSC3Q14574 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DSC3Q14574 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DSC3Q14574 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
DSC3Q14574 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DSC3Q14574 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DSC3Q14574 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DSC3Q14574 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DSC3Q14574 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DSC3Q14574 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DSC3Q14574 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DSC3Q14574 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
DSC3Q14574 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DSC3Q14574 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DSC3Q14574 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms